Although university autonomy was apparently protected during Carlos Menem's government (1989-1999), actually it was gradually undergoing substantial changes. "Intrusive" devices had been prepared by the executive power, thus causing the restriction of its objectives. This kind of state participation was less explicit than in the past, being now associated with the establishment of a system of "punishment and reward," in which financing is subordinated to "performance," evaluated according to the parameters of multilateral credit organizations . In this work, we analyse the way in which this conflict took place under Menem's government, contrasting the meanings given to the idea of autonomy by the government and by the public institution; attentin focuses on the case of the National University of Rosario. Aunque la autonomía universitaria fue aparentemente preservada durante el gobierno de Carlos Menem (1989-1999), en la práctica, experimentó cambios sustanciales, pergeñándose desde el Poder Ejecutivo, dispositivos de "intrusión" que limitaron sus alcances. De todas formas estas modalidades de intervención estatal asumieron un carácter menos explícito que en el pasado, y se asocian al establecimiento de un régimen de premios y castigos que supedita el financiamiento de las universidades a sus "rendimientos" evaluados según los parámetros definidos por los organismos multilaterales de crédito. En el presente trabajo abordaremos el modo en que esta tensión se manifestó bajo el gobierno de Menem, contrastando los alcances atribuidos a la idea de autonomía por el gobierno y las instituciones públicas adoptando como punto focal, la postura asumida por la Universidad Nacional de Rosario. (Nota 1)