OBJETIVO: proponer un sistema de núcleos conceptuales para ser abordados en el proceso docente-educativo de la asignatura Agentes Biológicos de la carrera de Medicina. MÉTODOS: se realizó una investigación pedagógica en la Facultad "Dr. Zoilo E. Marinello Vidaurreta" de Las Tunas durante los meses de noviembre y diciembre de 2005. Para determinar los elementos constituyentes del sistema se empleó la modelación. RESULTADOS: con un enfoque sistémico se definieron los conceptos, se identificaron como invariantes a patogenia, diagnóstico directo y prevención, se determinaron y explicaron las interrelaciones entre estos y los demás conceptos del sistema. CONCLUSIONES: el análisis sistémico de los conceptos patogenia, diagnóstico directo y prevención como invariantes del sistema de conocimientos, permite el cumplimiento de los objetivos formativos de la asignatura Agentes Biológicos de la carrera de Medicina.<br>AIM: to propose a conceptual nuclei system to be approached in the teaching-educative process of the Biological Agents subject in the medical career. METHODS: a pedagogical research was conducted in "Dr. Zoilo E. Marinello Vidaurreta" Faculty in Las Tunas province during november-december, 2005. Modeling was used to determine the constituents of the system. RESULTS: the concepts were defined by a systemic approach. They were identified as invariants to pathogeny, direct diagnosis and prevention. The interrelationships among them and other concepts of the system were determined and explained. CONCLUSIONS: the systemic analysis of the concepts pathogeny, direct diagnosis and prevention as invariants of the knowledge system, allows the fulfillment of the formative goals of the Biological Agents subject in the medical career.